El período de génesis y formación del mudéjar aragonés tiene lugar durante el siglo XIII, en un proceso que se inicia a partir de la conquista cristiana y que afectará de diferente manera a los distintos focos del arte mudéjar de la Península Ibérica.

Daroca es un lugar relevante ya que se conservan pocos de los testimonios del proceso de sustitución de las iglesias construidas tras la conquista cristiana por otras según la tradición mudéjar. En la iglesia  de San Juan de la Cuesta no se produjo una simple sustitución de material constructivo en la fábrica románica, sino la adaptación del nuevo sistema constructivo con elementos de la tradición islámica.

Así, la iglesia románica datada a mediados del siglo XIII, inicia su construcción por el ábside, utilizando piedra sillar, quedando interrumpida a media altura para continuar la fábrica en ladrillo.

La construcción de la iglesia de Santo Domingo de Silos de Daroca se remonta a mediados del siglo XII. Se iniciaron las obras en un primer periodo románico hasta que se ven interrumpidas durante un periodo de tiempo. Se trataba de una iglesia orientada al este cuyo ábside, en sus inicios, tenía planta semicircular. Tras la reanudación de las obras en el siglo XIII se modifica la estructura de dicho ábside y se le da una forma poligonal.  A mediados del siglo XIII, coincidiendo con la construcción del ábside de San Juan de la Cuesta, se decide continuar la construcción de la torre adoptando el estilo mudéjar, cambiando la piedra por el ladrillo. Su estructura va a ser considerada como la más antigua de las aragonesas conservadas.

A lo largo del siglo XIV se modifica la antigua iglesia romanica y se transforma en una iglesia de planta de salón acoplada al ábside y la torre. Se dispone en planta rectangular de tres naves y tres tramos cubiertos por bóveda de crucería que apea en pilares octogonales. La cabecera se remata con un ábside poligonal y los laterales en testero recto. 

En el siglo XVIII un incendio destruye prácticamente todo el cuerpo de naves conservándose el ábside, la torre, el coro de madera y el retablo dedicado al santo titular realizado por Bartolomé de Bermejo. 

El palacio de los Luna de Daroca es uno de los ejemplos de arquitectura civil mudéjar de Aragón. Su construcción se remonta a finales del siglo XIV y principios del XV. Es fruto del encargo de la familia de los Luna, de los que vemos su heráldica reflejada a lo largo de todo el edificio.

En su origen el edificio tuvo planta en forma de U. Contaba con una planta baja, planta noble y graneros. Todas ellas se encontraban dispuestas en torno a un patio interior central.

En relación con la planta baja, originalmente el acceso al interior del palacio se realizaba a través de la fachada por medio de un arco de medio punto que comunicaba a con la calle Mayor. Debido a la notable altura de la planta baja se realizó la división en dos, dando lugar así a un entresuelo.

La planta baja se encuentra dividida en tres partes en sentido transversal a la fachada, generando una planta en forma de U que da lugar a un patio interior.

Esta división se lleva a cabo por medio de arquerías sobre pilares, de las que han llegado hasta nuestros días aunque cegadas en sus luces, totalmente recuperables las de la izquierda; las arquerías del lado derecho fueron sustituidas, avanzado el s. XVI, por columnas toscanas y dinteles de madera sobre zapatas en una reforma posterior.